Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn3Q07409 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms