Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Sh3bp2Q06649 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Sh3bp2Q06649 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp2Q06649 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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