Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl21cP86793 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl21cP86793 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl21cP86793 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl21cP86793 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl21cP86793 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl21cP86793 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccl21cP86793 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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