Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp9xP70398 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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