Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tmem258P61166 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms