Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms