Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VdrP48281 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VdrP48281 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms