Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxraP28700 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxraP28700 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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RxraP28700 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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RxraP28700 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxraP28700 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxraP28700 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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