Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18532 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P18532 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18532 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18532 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18532 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18532 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18532 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
P18532 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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P18532 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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P18532 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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P18532 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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