Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P18529 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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P18529 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18529 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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