Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms