Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Calb1P12658 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Calb1P12658 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms