Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtcP11725 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtcP11725 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtcP11725 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtcP11725 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
OtcP11725 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms