Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DmdP11531 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DmdP11531 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DmdP11531 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms