Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ifna9P09235 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms