Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LtaP09225 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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