Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P04212 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P04212 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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