Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tgfb1P04202 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tgfb1P04202 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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