Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifna2P01573 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms