Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MttpO08601 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MttpO08601 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms