Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms