Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms