Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ddx60E9PZQ1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ddx60E9PZQ1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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