Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms