Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myom3A2ABU4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms