Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm26992S4R1A3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm26992S4R1A3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms