Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp5Q9Z2P8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp5Q9Z2P8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms