Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rlbp1Q9Z275 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rlbp1Q9Z275 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rlbp1Q9Z275 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms