Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccne2Q9Z238 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccne2Q9Z238 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccne2Q9Z238 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne2Q9Z238 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms