Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clic1Q9Z1Q5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clic1Q9Z1Q5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms