Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lgr5Q9Z1P4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lgr5Q9Z1P4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms