Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nek4Q9Z1J2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek4Q9Z1J2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms