Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmg20bQ9Z104 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmg20bQ9Z104 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms