Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUQ2

Preb, Prolactin regulatory element-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrebQ9WUQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrebQ9WUQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrebQ9WUQ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrebQ9WUQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrebQ9WUQ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms