Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl5Q9WUP7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms