Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scnn1bQ9WU38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms