Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Skp1Q9WTX5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skp1Q9WTX5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skp1Q9WTX5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms