Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp18Q9WTV6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Usp18Q9WTV6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp18Q9WTV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp18Q9WTV6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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