Protein–RNA interactions for Protein: Q9R2B6

St6galnac4, Alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3-N-acetyl-galactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac4Q9R2B6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
St6galnac4Q9R2B6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
St6galnac4Q9R2B6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
St6galnac4Q9R2B6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
St6galnac4Q9R2B6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
St6galnac4Q9R2B6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
St6galnac4Q9R2B6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
St6galnac4Q9R2B6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
St6galnac4Q9R2B6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
St6galnac4Q9R2B6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms