Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TapbpQ9R233 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms