Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc26a4Q9R155 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms