Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt71Q9R0H5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt71Q9R0H5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt71Q9R0H5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt71Q9R0H5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt71Q9R0H5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt71Q9R0H5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms