Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AmfrQ9R049 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms