Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb11Q9QY30 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb11Q9QY30 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms