Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354bQ9QXT9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354bQ9QXT9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354bQ9QXT9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms