Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Apbb1Q9QXJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apbb1Q9QXJ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms