Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChmQ9QXG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChmQ9QXG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms