Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53inp1Q9QXE4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms