Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chaf1aQ9QWF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms