Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cln8Q9QUK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms